В самом начале 1942 года был принят к серийному производству самолет ju-88c-6, который был
создан на основе бомбардировщика ju-88А-4. Как и на базовой модели, на данный самолет
устанавливались двигатели Jumo 211J-2 или 211J-1. Тормозами данный самолет не комплектовали,
хотя в полевых испытаниях на некоторые машины воздушны тормоз устанавливали. Набор вооружения
ju-88c-6 в основном не отличалась от вооружения ju-88c-4. Так в носу самолета имелось три
пулемета и одна пушка. На лафете в нижней установке располагался пулемет MG -15, MG -131 или же
81Z. Как и на предыдущих версиях ju-88c-6 мог брать на борт до полутоны бомб, на внешнюю или
внутреннюю подвески или же оснащаться дополнительными топливными баками .объемом 650 и 1600
литров.